El objetivo del programa es la protección y restauración de lagos y humedales, paisajes relacionados y su biodiversidad en los 10 países involucrados y más allá. La atención se centra en las actividades de creación de capacidad para todas las partes interesadas involucradas en la gestión de lagos y humedales (autoridades locales, administraciones regionales, sociedad civil) para reducir los impactos en los ecosistemas acuáticos de los agricultores, pescadores, turismo y otros actores. Además, el desarrollo y la promoción de técnicas innovadoras para la protección y restauración de lagos y humedales, es decir, tratamiento de aguas residuales, prevención de la contaminación, restauración, gestión de especies invasoras, agricultura respetuosa con la biodiversidad. En tercer lugar, la difusión de resultados transferibles y lecciones aprendidas a nivel regional, nacional y mundial a través de la Red Internacional de Lagos Vivos y una mejor implementación de la legislación de protección de lagos y planes de gestión mediante el empoderamiento de la sociedad civil y su participación en las consultas de las partes interesadas.